传统四合院是单层建筑，以若干个房屋为基础，分布在一个平面上。而当今农村建筑的主流早已不是单层，而是双层建筑，因此想要建造四合院的话，两层四合院必定是中式设计的主流形式。
两层四合院具有别墅的性质，除了具备现代化设施之外，还具备四合院的特点，比如合围式住宅，中间有庭院，装饰是中式的。另外，两层四合院可以最大化利用正房空间，让全部家人可以住在最舒适的位置，有最好的朝向。
两层四合院设计，和四合院还是有些区别的，一般正房与厢房都是连在一起的，从室内就可以相互通行。而且，说是两层建筑，其实还可以想地下扩展，挖个地下室之类的，不仅可以停车，也可以有其他用途。
两层四合院设计，方位依旧是按照传统四合院布局，正房位于正北、东西为厢房、南侧为倒座房。在宅院的东南角，依旧是宅门。按照设计来说，倒座房最好是单层的，一是和宅门匹配，而是不遮挡正房二层的视线，可以畅快的眺望远方。
两层四合院设计，可以极大地满足居住需求，增加宅基地空间使用率。哪怕是单纯的一进院落，房间数也比单层两进四合院要多。更多的需求，比如健身房、制作室之类的都可以加入其中，满足业主个人需求。
