过去和现代不同，能够用于房子本身的建筑材料不多，大部分取材于自然。现在的钢筋水泥都是工业品，所以建筑材料丰富了很多，给了人们更多的选择。古代四合院按照结构来说，使用的主要材料大体上有木材、泥土和石材。
构成四合院房屋的是木架，因此木材是四合院的骨架。有了骨架之后，就要砌墙覆瓦，这些砖瓦都是取自于优质的黏土。四合院房屋整体坐落于台基之上，而台基很多都是用石材制作的。这些就是四合院建筑材料主要使用的地方。
除了用于主体建筑上，这三种材料还用于四合院的装饰。比如木材方面，可以应用于门窗，也可以应用于木雕，比如雀替等。而砖瓦，则有砖雕等构件，出现在影壁和房顶这些地方。最后是石材，可以作为大门的门枕和门墩，可以做成上马石和下马石等。
除了主要的木材、黏土和石头外，四合院还使用了大量的油漆，主要是涂在裸露在外的木头上，起到保护木材的作用。油漆的涂抹造就了四合院丰富的彩绘装饰，让四合院的色调出现了更多的变化。
现在新中式四合院别墅设计，应用的材料更多，和现代建筑基本一样，只不过木材的使用较多。比如，古建筑四合院没有钢筋水泥和玻璃等材料，新中式建筑中这两样材料使用更多，因此房屋结构更稳定、采光更加充足。
